东南大学自1952年全国高校院系调整后就开始招收研究生，50年代后期和60年代初期共招收研究生117人，1978年恢复招收研究生，1981年实施学位条例后， 是首批获学士、硕士、博士学位授予的单位；是首批建有博士后流动站的单位；是首批通过国家"211工程"部门预审并获国家立项资助的大学之一；是自行审批硕士点、自行审定增列博士生指导教师的试点单位之一； 也是首批获准招收和培养工程硕士生的单位之一。1986年4月经国务院批准试办研究生院，1996年3月经国家教委批准，正式建立研究生院。 现有中国科学院院士2名、中国工程院院士7名、博士生指导教师460多名、硕士生指导教师1100多名。东南大学和许多重点高校一样，已成为我国研究生培养的一个重要基地。
    东南大学现有16个一级学科博士学位授权点，96个博士点，30个一级学科硕士学位授权点，209个硕士点，覆盖现有研究生学科、专业目录中的12个门类的哲学、经济学、 法学、教育学、文学、理学、工学、医学、管理学等9个门类。
    20多年来，东南大学共招收博士生5224名；硕士生24057名，其中MBA848名；在职人员攻读硕士学位招生6390名。已授博士学位2404名，硕士学位18997名，其中以同等学力申请博士学位9名， 同等学力申请硕士学位312名,建筑学硕士266名,工程硕士专业学位1528名，工商管理硕士专业学位1203名，中职教师在职人员攻读硕士学位297名,高校教师在职人员攻读硕士学位60名,公共卫生硕士专业学位22名。
    回顾东南大学研究生教育改革与发展的历程，我们的主要做法是：

• 我校试行研究生培养机制改革，设立研究生培养基金，包括奖助学金、“三助”岗位津贴和专项基金，实行集中管理、统筹使用。硕士研究生奖助学金共设四等，博士研究生培养基金分A、B两级，由学校下达各类奖助学金指标，各院系制定评定细则并进行评审，最后报研究生院审批。其中博士生培养基金岗位由学校支持经费和导师科研经费共同设置，且以导师为主向学校申请，明确了“所有研究生必须是在导师指导下通过科研完成学业”的培养特点。 我校已制定并出台了《东南大学研究生培养基金实施办法(暂行)》，以保障研究生培养基金一年一评、滚动管理的顺利实施。实行研究生培养机制改革，研究生的奖助学金与其学习成绩和科研成果挂钩，一年一评，动态管理，更有利于调动学习积极性，激发科研创新精神。
• 加强对"985工程"和"211工程"学科建设项目的管理，促进学科的全面发展，不断提高学科的核心竞争力。
• 进一步调整学科布局，形成以工为主、理工医结合、科技与人文交融、工理医文管协调发展的学科建设新格局。
• 加快发展研究生教育，提高高层次人才培养质量。调整办学结构，从培养本科生为主转移到本科教育和研究生教育并重的战略轨道上来，同时调整本科和研究生培养的学科结构和内部结构。
• 抓住教师队伍的新老交替的有利契机，加快教师队伍的结构调整，逐步建立起一支国内外开放，以著名专家和知名学术带头人为核心，以具有博士、硕士学位的年青教师为主的结构合理、素质较高、充满活力的教师队伍。
• 进一步深化校内体制改革，逐步建立起适应社会主义市场经济，有自己特色的管理体制和运行机制，发展合作共建，积极为地方经济建设服务，形成开放办学的新局面，多渠道筹措资金，为学校进一步发展创造良好的内部和外部条件。
• 对高层次人才培养，我们的指导原则是：在培养方向上，科学、规范、拓宽，重点突出一个"宽"字；在培养目标上，着眼未来，瞄准前沿，重点突出一个"新"字；在培养环节上，优化结构、增大柔性，重点突出一个"活"字；在管理方式上，加强目标管理，抓好过程监控，重点突出一个"严"字。
• 积极开展学位与研究生教育工作的理论研究。
  建院以来，我院始终强调在做好事务性工作的前提下，要积极开展学位与研究生教育的理论研究，从而使管理工作达到一个新的高度。鼓励管理人员向高水平的学术刊物投稿，多出高水平的理论成果。